7 Shiny + R Markdown
7.1 Introducción
En esta última sesión (práctica) del taller, exploraremos una manera diferente de emplear Shiny. En particular, no vía archivos de tipo .R, donde separamos claramente la interfaz de usuario, de la función servidor; sino, principalmente, vía un único documento, y de tipo .Rmd .
7.2 Motivación
¿Qué beneficios ganamos al emplear Shiny y R Markdown de manera conjunta?
- Sintaxis más simple para introducir elementos Shiny a la página web.
- Poder crear reportes interactivos y/o parametrizados.
- Vía el uso de chunks (bloques de código), es más sencillo organizar el código (sea de R, Python, CSS, JavaScript) de la aplicación, todo en un mismo documento de tipo .Rmd.
7.3 Proyectos finales del taller
7.3.1 Actualizar una base de datos asociada a una app Shiny
El codigo de este proyecto lo pueden encontrar en este link.
Básicamente, emplearemos el paquete googlesheets4 de R para, luego de crear una hoja de cálculo usando Google Sheets, utilizar R con el fin de actualizar el contenido de dicha hoja de cálculo, actualizando así nuestra base de datos que se estará leyendo por medio de una aplicación Shiny.
- Links relevantes:
- Página de la librería googlesheets4.
- Otras maneras de guardar data de manera remota para una aplicación Shiny.
- Ejemplo sobre guardar data remotamente, usando Google Sheets y Shiny.
7.3.2 Creación de un reporte parametrizado
El codigo de este proyecto lo pueden encontrar en este link.
Nos familizaremos con R Markdown, empleándolo para crear un reporte que nos permita renderizarlo de manera automática, tras fijas ciertos parámetros para el reporte, y generar así automáticamente diversas versiones de un mismo reporte modelo que habremos creado.
7.3.3 Creación de un dashboard interactivo
El codigo de este proyecto lo pueden encontrar en este link.
En este último proyecto del taller, combinaremos tres paquetes de R: R Mardkown junto a flexdashboard, para crear un dashboard; y, Shiny, para añadir interactividad a aquel dashboard.
Esto con la finalidad de combinar ambos proyectos previos, dentro de una misma aplicación Shiny, cuya interfaz de usuario es un dashboard.
Ejemplos de dashboards creados con el paquete flexdashboard.
Resulta más sencillo (respecto a la sintaxis) utilizar elementos interactivos de Shiny, en documentos de tipo .Rmd, que de tipo .R. Entonces, pese a que es más común emplear el paquete shinydashboard, para crear dashboards interactivos con Shiny, nosotros utilizaremos el paquete flexdashboard para poder crear nuestro dashboard vía un archivo .Rmd.
Aclaro que, para convertir un archivo .Rmd con output de tipo html, a una aplicación Shiny, en general basta añadir runtime: shiny en el encabezado YAML del documento .Rmd. Esta combinación de R Markdown y Shiny no requiere del paquete flexdashboard.
- Links relevantes:
- Documentación del paquete flexdashboard.
- Otra solución a problema del botón de descarga de Shiny, cuando se usa con flexdashboard.
- Uso de bslib para actualizar en vivo el diseño de nuestro dashboard.
7.4 Publicar una aplicación Shiny en internet
Les recomiendo este tutorial sobre cómo subir a internet, por medio de una cuenta en shinyapps.io, una aplicación Shiny que hayas creado.
Posiblemente requieran instalar el paquete rsconnect:
installed.packages("rsconnect")7.5 Comentarios finales
7.5.1 Shiny + JavaScript
Según el sílabo, en esta sesión se exploraria cómo emplear de manera conjunta Shiny y JavaScript, pero, por motivos de tiempo, no se logró.
Así que, si les interesa ese tema de enorme potencial, el cual, resulta ser la razón por la que Shiny es mi paquete favorito de R, les recomiendo leer la sección Web Development with Shiny del libro JavaScript for R.
7.5.2 Seguir estudiando Shiny
Si les interesa seguir avanzando con el libro que hemos estado usando en este taller, Mastering Shiny, les recomiendo unirse a esta comunidad.
En es grupo, hay un club de lectura sobre el libro Mastering Shiny, y, hasta el 16 de agosto del 2022, se encuentran en el capítulo 15 del libro.
Sin embargo, a partir del capítulo 5 de ese mismo libro, estos capítulos no están tan relacionados entre si, así que no se pierden gran cosa por unirse tarde a tal club de lectura.
Tras este taller, ustedes ya tienen suficiente base en Shiny, como para profundizar en un nivel básico-intermedio de Shiny.
7.6 Tarea
- Avanzar su proyecto personal del taller, para presentarlo el día miércoles 24 de agosto del 2022, en la última sesión de este taller.